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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

成都石室中学纪念文翁兴学2165年******

　　中新网成都12月12日电 (记者 贺劭清)文翁兴学2165年暨成都石室中学改办新学120周年纪念活动12日在成都石室中学北湖校区举行。

　　据了解，成都石室中学前身为西汉景帝末年(约公元前143年)时任蜀郡太守文翁创建的“石室精舍”，是中国历史上第一所地方政府官办学校。两千多年来，这座学校虽然多次易名，但校址从未更变，办学一直延续，走出了司马相如、杨雄、刘光第、郭沫若等杰出校友。

　　石室中学校长田间介绍，今年不仅是文翁兴学2165周年，还是成都石室中学改办新学120周年。1902年清政府颁布《钦定学堂章程》，成都石室中学在全国率先实施，完成由科举制向新学制的变革，成为四川历史上第一所现代公立中学，引领了全川教育的近代化转型。

　　活动期间，成都石室中学分别与中国移动四川公司、乐山市夹江县、遂宁市安居区、广元市苍溪县以及泸定中学签署合作协议。成都石室中学教育集团2022年年会也同期举行，目前石室中学教育集团共有21所学校，29个办学点，还与数十所学校及单位建立了友好合作关系，为促进区域协同发展及教育欠发达地区的提升做出了自己的贡献。

　　中国作家协会副主席、四川省作家协会主席阿来为成都石室中学的学生们带来《书籍过剩时代如何读书》专题讲座。讲座中，阿来分享了他的文学人生和阅读生活，并给同学们提出了一些关于阅读的建议。阿来表示，读书是对自己精神和道德修为进行提升的途径，是对价值观的追求，不应被赋予功利性的目的，大家应根据自己的兴趣和需要去阅读。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）